Microbiomics
ZymoBIOMICS®
近年來熱門的研究主題：microbiomics/metagenomics。傳統微生物研究，必須需透過微生物培養放大方能進行實驗。然而有 99% 的微生物無法於實驗室進行培養，使得微生物研究受到限制。微生物體學 (Microbiomics / Metagenomics) 利用次世代定序 (NGS) 技術進行菌相分析，不必再透過微生物培養即能進行研究，然而目前發現這類的研究結果常存在著不準確，再現性差的問題，原因從樣品的採集保存、微生物核酸的萃取、NGS 的文庫建構以及生物資訊的分析，都有可能出現偏差、誤差，而造成同樣的樣品在不同時間操作，實驗結果會不一樣，還有同樣的樣品不同實驗室操作，實驗結果也不太相同。
ZymoBIOMICS 系列產品幫助研究學者克服這些痛點，從樣品採集保存、核酸萃取、NGS 文庫建構以及各種微生物標準品，可更有效建立完善的實驗流程，不用再擔心實驗結果不可信的問題。
A Complete Microbiomics Solution from Collection to Conclusion
標準品的組成菌種類、基因資訊清楚詳細
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利用準確的標準品進行實驗流程驗證，找出其中的誤差並消除，以得到更一致更優質的實驗結果
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ZymoBIOMICS 標準品 (Microbiome standard) 大哉問
為什麼要用標準品？
目前研究人員的最大痛點就是 Data 再現性，同樣的樣本不同人做結果不一樣，同樣的樣本存放時間不一樣做出來的結果也不一樣，所以會出現不知道該相信哪次的結果，導致研究進度停滯不前。所以需要更嚴格更謹慎的態度來檢視整套實驗流程的準確性，利用準確的標準品進行實驗平台驗證，從中找出實驗誤差並消除，以得到更一致更優質的實驗結果。
怎麼選用標準品？
若研究主題偏生物環境菌相分析，需要幫忙找出實驗平台的誤差
推薦 Microbial Community Standard I (Even Abundance) #D6300 (細菌)、#D6305,D6306 (DNA)，混合 8 種細菌 2 組酵母菌，細菌的分布是等分分布。
若研究主題偏病源菌分析，需要高靈敏度平台以可以偵測出病源菌的存在
推薦 Microbial Community Standard II (Log Distribution) #D6310(細菌) #D6311(DNA)，混合 8 種細菌 2 組酵母菌，細菌的分布是對數分布，最小量細菌只有 100 個細胞。
若研究主題偏腸道菌相分析，需要更擬真的標準品進行實驗驗證
推薦新產品 Gut Microbiome Standard #D6311
樣品保存於 DNA/RNA shield，有效破壞微生物的活性，不用擔心微生物狀態會改變，實驗結果不會失真。
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操作流程簡單，使用物理性的方式破壞樣品，不會出現陰性菌多於陽性菌的結果
最快速的 16S 建庫方法，利用 enzyme clean up 和透過 qPCR 方式建庫和定量，大大縮短操作時間
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全新的 V1-V2, V3-V4 primers，提高微生物覆蓋率
Product Guide
Microbiome Standards
透過已知菌落群，檢視整套實驗，利於優化操作流程
- ZymoBIOMICS Microbial Community Standard
- ZymoBIOMICS Microbial Community Standard II (Log Distribution)
- ZymoBIOMICS Spike-in Control I (High Microbial Load)
- ZymoBIOMICS Spike-in Control II (Low Microbial Load)
- ZymoBIOMICS HMW DNA Standard
- ZymoBIOMICS Gut Microbiome Standard
Sample Collection
穩定保存樣品中的核酸
- DNA/RNA Shield
- DNA/RNA Shield Fecal Collection Tube
- DNA/RNA Shield Collection Tube w/ Swab
- DNA/RNA Shield Lysis & Collection Tubes
- DNA/RNA Shield Saliva Collection Kit
- DNA/RNA Shield Blood Collection Tube
- Urine Conditioning Buffer
DNA/RNA Extraction
利用 BashingBead™ 均質化，無偏差的萃取微生物的 DNA/RNA
- ZymoBIOMICS DNA Miniprep Kit
- ZymoBIOMICS RNA Miniprep Kit
- ZymoBIOMICS DNA/RNA Miniprep Kit
移除 Host DNA，保留微生物 DNA，不浪費 NGS reads
- HostZERO Microbial DNA Kit
- Quick-DNA HMW MagBead Kit
NGS Analysis
從收集檢體到結果分析，提供完整專業的服務
- ZymoBIOMICS Targeted Sequencing Service: 16S (V1-V2, V3-V4, V4, or V6-V8)
- ZymoBIOMICS Targeted Sequencing Service: ITS
- ZymoBIOMICS Targeted Sequencing Service: 18S
- ZymoBIOMICS Shotgun Metagenomic Service