COVID-19 系列文二：病毒變異監控
病毒變異監控：定序速度是關鍵。
接續上一篇，多國都致力於對 COVID-19 病毒進行準確、快速且接近樣本的病毒突變的監測，以提供快速有效的訊息。隨著疫情的發展及防控措施的不斷加強和深入，這種即時部署的能力對指導制定切實可行的控制和應對措施至關重要。
作為唯一能夠提供即時分析及快速觀測的三代基因組定序技術，從可攜式掌上定序儀到高通量測序設備，奈米孔測序可分析天然 DNA 或 RNA 並定序短片段至超長片段的任何長度的序列， Oxford Nanopore 這次也在第一時間予以技術支持，為疫情防控提供最快速、即時和有效的資訊回饋：
Jan 26th
中國疾病預防控制中心表示，目前尚未發現病毒發生變異，科學家們一直在密切追踪新型冠狀病毒的發展情況。而由於三代定序技術的發展，可以很快看到它的各種變化。
Jan 29th
The Lancet 期刊發表了關於新型冠狀病毒的基因組學鑑定和流行病學的文章，利用包括 Oxford Nanopore 的三代定序技術，對 COVID-19 患者的全長基因組進行分析，提供了可能的病毒來源和細胞結合受體的重要訊息，這些訊息對溯源、持續監測變異和確定傳播能力至關重要。
Jan 31th
Oxford Nanopore 向中國運送了 200 台 MinION 掌上定序儀和相關耗材，這些設備和耗材將用於支持對當前 COVID-19 疫情爆發的持續監控。
Feb 3th
比利時魯汶大學 Piet Maes 教授宣布其團隊使用 MinION 和 ARTIC 方案，僅用 8 小時就完成了首例比利時新冠病毒全基因組測序。研究小組在晚上 9 點收到可疑樣品，並在第二天凌晨 5 點確認了完整的基因組。
Feb 3th
杭州市疾控中心率先使用 ARTIC Network 發佈的 2019-nCoV 定序實驗方案，使用掌上 MinION 定序儀完成準確 COVID-19 病毒基因組組裝，並已上傳至 GISAID 數據庫。團隊在未使用其他測序技術進行矯正的情況下，獲得的最終組裝結果與參考基因組一致性為 100%。
由於 COVID-19 病毒會不斷在其遺傳物質中引起微小的突變，在結合其他類型的數據，如病例數量和地理分佈時，即時快速的獲取並共享基因組數據能夠使公共衛生人員追踪新型冠狀病毒的起源和在世界各國的傳播，以便更好的響應疫情控制措施。
MinION 掌上測序儀的重量不到 100 克，可與筆電或專用可攜式分析配件 MinIT 一起進行數據分析。它即時傳輸序列數據，從而實現快速定序。它也非常適合在任意分佈的地點進行快速定序。MinION 設備已被用在農村或偏遠地區進行定序分析以監測各種疫情狀況。
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