TCR, BCR Profiling & Single-Cell Analysis System 介紹
# TCR, BCR Profiling 免疫細胞基因庫建構
Takara Bio 獨家 SMART、RACE 技術合體，製備最完整的免疫細胞基因庫
免疫細胞 (T & B 細胞) 上的 T-Cell Receptor 及 B-Cell Receptor 為免疫系統用來辨識外來病原體的工具。透過研究 T-Cell Receptor 及 B-Cell Receptor 其 clonotypes 的多樣性，不僅可以了解健康個體的適應性免疫 (adaptive immune) 反應，還可更明白免疫系統與多種疾病的關係，提供人類開發針對特定疾病的免疫療法模型。
Takara Bio 的產品從 RNA 或細胞開始，利用 SMART (Switching Mechanism at 5' End of RNA Template) 與 5' RACE 技術結合來捕獲 V(D)J 序列，從而簡化了整個製備基因庫的過程。
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Human Repertoire 人類免疫細胞基因庫 |
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產品 |
SMARTer Human scTCR a/b Profiling Kit |
SMARTer® Human TCR a/b Profiling Kit v2 |
SMARTer® Human BCR IgG IgM H/K/L Profiling Kit |
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樣本來源 |
單細胞 (1- 96 cells) |
1. 10 ng-1 µg Total RNA (周邊血白血球) |
1. 10 ng-1 µg Total RNA (周邊血白血球) |
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原理 |
利用 SMART cDNA Synthesis 技術進行全長基因反轉錄，再搭配 RACE-based PCR 針對 TCR 或是 BCR 轉錄體的 V(D)J variable regions 進行特定基因擴增 |
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後續適用定序平台 |
Illumina |
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應用 |
・了解單細胞中 TCRα 與 TCRβ chains 配對的狀況 ・人類 TCR 基因組庫分析 (TCRα 和 TCRβ subunits)
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人類 TCR 基因組庫分析 (TCRα 和 TCRβ subunits) |
人類 BCR 基因組庫分析 (heavy 和 light [kappa & lambda] chains ) |
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特色 |
1. 優化的 index 可將 96 個細胞混合製備成 12 個基因庫，並可進一步混合於同一條 flow cell lane中定序
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1. 以 UMI 訊息進行校正，移除 PCR duplicates 和定序錯誤產生的 reads
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1. 以 UMI 訊息進行校正，移除 PCR duplicates 和定序錯誤產生的 reads
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貨號/包裝 |
634431 (96 Rxns, 12 pooled rxns from 96 cells) 634432 (480 Rxns, 60 pooled rxns from 480 cells) |
634478 (12 Rxns, 24U UDI) |
634466 (12 Rxns) |
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操作手冊 |
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分析軟體 |
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Mouse Repertoire 小鼠免疫細胞基因庫 |
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產品 |
SMARTer® Mouse TCR a/b Profiling Kit |
SMARTer® Mouse BCR IgG H/K/L Profiling Kit |
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樣本來源 |
1. 10 -500 ng Total RNA (小鼠脾臟、胸腺、周邊血白血球) |
10 -3000 ng Total RNA (小鼠脾臟、胸腺、周邊血白血球) |
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原理 |
利用 SMART cDNA Synthesis 技術進行全長基因反轉錄，再搭配 RACE-based PCR 針對 TCR 或是 BCR 轉錄體的 V(D)J variable regions 進行特定基因擴增 |
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後續適用定序平台 |
Illumina |
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應用 |
小鼠 TCR 基因組庫分析 (TCRα 和 TCRβ subunits) |
小鼠 BCR 基因組庫分析 (heavy 和 light [kappa & lambda] chains ) |
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特色 |
1. 獲得完整的 V(D)J 序列訊 |
1. 精準擴增和偵測 mouse IgG subclasses |
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貨號/包裝 |
634402 (12 Rxns) |
634422 (12 Rxns) |
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操作手冊 |
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# BD Rhapsody™ Single-Cell Analysis System 單細胞基因表現分析系統
全新單細胞捕獲系統，實現單細胞多體學研究的最佳工具
單細胞的實驗除了使用 FACS 進行單顆細胞的分離，市面上多款的單細胞分選及建庫系統當中，以熱門新星 BD Rhapsody™ Single-Cell Analysis System 最為吸引目光！其最大的特點在於能夠同時探討單細胞基因體與蛋白體學 (Ab-Seq) 層面，以高通量多體學的角度了解細胞之間的異質性對於組織或疾病的影響，甚至病原與宿主之間複雜的交互作用。近期新推出的 TCR/BCR 分析搭配新一代磁珠，可完美結合原先 WTA/Targeted-RNA 與 AbSeq 應用，為研究提供更多維度的解析。
A brief workflow of BD Rhapsody TCR analysis
Microwells 高效率補獲細胞， 不因管道堵塞丟失樣本
可執行 100-40,000 大範圍單細胞實驗
提供 scRNA-Seq, Targeted-RNA seq 與 VDJ 等應用
多體學研究：AbSeq 實現單細胞基因與蛋白同時分析
Sample Multiplexing kit 提供混樣上機
88 萬組獨特 CL 序列標記單細胞、專利 UMI 計算真實基因表現
Seven Bridges Genomics 雲端平台，SeqGeq 視覺化分析軟體支援
唯一即時提供QC的單細胞平台，為每個上機流程把關
・Sample QC: 上機前細胞濃度與存活率
・Cartridge QC: 細胞與磁珠沉降效率、複數細胞及回收效率等
| 應用 | 品名 | 貨號 | 包裝 |
| 單細胞分離及基因庫建構 | 儀器- BD Rhapsody Express Package | 633707 | Each |
| 儀器- BD Rhapsody Scanner | 633701 | Each | |
| BD Rhapsody cDNA Kit | 633773 | Each | |
| BD Rhapsody WTA Amplication Kit | 633801 | Each | |
| BD Rhapsody Enhanced Cartridge Reagent Kit | 664887 | Each | |
| BD Rhapsody TCR/BCR Amplification Kit | 665345 | Each | |
| BD Rhapsody Cartridge Kit | 633733 | Each | |
| Human Single Cell Sample Multiplexing Kit | 633781 | 12 samples | |
| Mouse Immune Single-Cell Multiplexing | 633793 | 12 samples |
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